Το Mage Academy είναι μια επική ιαπωνική ιστορία περιπέτειας του καλού έναντι του κακού. Παίζετε ως Rei, ένα νεαρό κορίτσι που είναι φοιτητής στην Ακαδημία μαγείας που χρηματοδοτήθηκε με στόχο να κρατήσει έναν ισχυρό μάγο αιχμάλωτο, ώστε να μην αναλάβει τον κόσμο. Αλλά ενώ βρίσκεστε σε τακτική επιθεώρηση, παρατηρείτε περίεργα τέρατα που κλήθηκαν στο σχολείο. Αυτό δεν είναι καλό σημάδι. Ακολουθούν βιασμοί και κραυγές. Θα χρειαστεί να σκοτώσετε όλα τα τέρατα μέχρι να αντιμετωπίσετε το τελικό αφεντικό, Mage Xerox που θέλει να αναλάβει τον κόσμο. Η περιπέτεια έρχεται με πολλά φύλο μάχες και είναι όλα κινούμενα.